经常有人问我单细胞GSVA分析应该用Seurat对象中的哪个数据，因为我此前的推文《单细胞转录组高级分析五：GSEA与GSVA分析》用的counts数据，后面有一篇推文《非人物种的GSEAGSVA分析》用的是data数据。还有人推荐用scale.data，据说运行起来比counts数据快不少。很多人对此迷惑了，到底该用那个数据呢？
测试数据来源
测试数据来源于10xgenomics