单细胞GSVA分析该用什么数据 - 类别 - 三白草三白草

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发送短消息 UID 222 精华 0 查看公共资料搜索主题搜索帖子 TUhjnbcbe TUhjnbcbe 组别新手上路生日帖子1 积分11 性别注册时间2020-03-27	1^# 字体大小: t T 发表于 2021-04-08 16:57 \|只看楼主经常有人问我单细胞GSVA分析应该用Seurat对象中的哪个数据，因为我此前的推文《单细胞转录组高级分析五：GSEA与GSVA分析》用的counts数据，后面有一篇推文《非人物种的GSEAGSVA分析》用的是data数据。还有人推荐用scale.data，据说运行起来比counts数据快不少。很多人对此迷惑了，到底该用那个数据呢？测试数据来源测试数据来源于10xgenomics
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