三白草

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CIBERSORT免疫浸润的代码实现 [复制链接]

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今天是生信星球陪你的第天大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!

目前主流的免疫浸润计算方法是CIBERSORT和ssgsea,今天介绍CIBERSORT。参考:cibersoft使用SVM算法实现去卷积。

1.输入数据要什么

下面这段话摘自CIBERSORT的介绍

Importantly,allexpressiondatashouldbenon-negative,devoidofmissingvalues,andrepresentedinnon-loglinearspace.

ForAffymetrixmicroarrays,acustomchipdefinitionfile(CDF)isre

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